云南完成鐵皮石斛基因精細(xì)圖譜
9月4日上午,云南完成鐵皮石斛基因精細(xì)圖譜科技成果新聞通氣會在云南普洱市舉行。該項目組用一年半時間,完成了鐵皮石斛全基因組測序工作,繪制了鐵皮石斛的全基因精細(xì)圖譜。
目前,測序深度已達(dá)鐵皮石斛基因組大小的200倍,測序結(jié)果已覆蓋95%的全基因組和97%的基因編碼區(qū),超過國際上同行復(fù)雜基因測序的最高水平。研究組進(jìn)一步解析了鐵皮石斛基因組中的基因信息,發(fā)現(xiàn)了48200多個蛋白質(zhì)編碼基因,其基因數(shù)目是目前所有已經(jīng)測序的植物中最多的,從基因水平證實了鐵皮石斛基因組的復(fù)雜性。
作為聯(lián)盟成員單位的云南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合普洱市普洱茶研究院,以云南農(nóng)業(yè)大學(xué)盛軍校長(普洱市副市長)、昆明動物研究所王文研究員為課題組組長,全面展開了云南鐵皮石斛基因組計劃的實施。使用目前最新的第二代測序技術(shù)和近期剛剛引入國內(nèi)的第三代單分子測序技術(shù),完成了鐵皮石斛全基因組測序工作。
中藥現(xiàn)代化和國際化必需依靠科技創(chuàng)新來實現(xiàn),基因組測序技術(shù)的進(jìn)步為中藥現(xiàn)代化提供了強大的科技支撐。該項目發(fā)起人、云南農(nóng)業(yè)大學(xué)校長、普洱市副市長盛軍教授指出,鐵皮石斛基因組的完成,將會改變鐵皮石斛產(chǎn)業(yè)憑經(jīng)驗發(fā)展的現(xiàn)狀,為品種鑒定、基因育種、成分和功能研究以及新產(chǎn)品開發(fā)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),將持續(xù)推動云南石斛產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。
該項目的另一負(fù)責(zé)人王文研究員從基礎(chǔ)研究層面充分肯定了鐵皮石斛基因組的意義,他認(rèn)為,鐵皮石斛基因組將為蘭科植物的起源、演化和特性研究提供最基礎(chǔ)數(shù)據(jù),作為第一個被解析的藥食同用植物基因組,也將進(jìn)一步提振中藥的國際知名度,促進(jìn)中草藥的現(xiàn)代化。
2012年底,云南石斛種植面積超過6萬畝,產(chǎn)值已達(dá)到30億元。2012年1月,在云南省科技廳的支持下,云南省成立了石斛產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟,并設(shè)立專項經(jīng)費開展了云南鐵皮石斛地理標(biāo)志研究、云南鐵皮石斛質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究、云南省石斛科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃以及鐵皮石斛基因組計劃等課題。
據(jù)悉,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)已經(jīng)建立“中國藥用植物基因組數(shù)據(jù)庫”,向全世界提供中國科學(xué)家在中國傳統(tǒng)中醫(yī)藥理論的最新研究成果。同時,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)將在未來3年內(nèi),以云南特色中藥材為基礎(chǔ),開展系統(tǒng)的基礎(chǔ)研究和應(yīng)用開發(fā),全面開展云南特色中藥材基因組研究和開發(fā),著力打造獨具特色的云南生物藥業(yè)。
(記者 李映青 郭安菲)
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