民族矛盾和階級(jí)矛盾交織，使國(guó)家政局空前復(fù)雜。黨從抗戰(zhàn)的全局出發(fā)，明確指出:整個(gè)抗戰(zhàn)時(shí)期，民族矛盾始終是第一位的，各階級(jí)的利益必須服從全民族的利益。針對(duì)國(guó)內(nèi)時(shí)局的逆轉(zhuǎn)趨勢(shì)，黨鮮明地提出堅(jiān)持抗戰(zhàn)到底反對(duì)中途妥協(xié)、鞏固國(guó)內(nèi)團(tuán)結(jié)反對(duì)內(nèi)部分裂、力求全國(guó)進(jìn)步反對(duì)向后倒退三大口號(hào)，堅(jiān)決揭露打擊賣(mài)國(guó)漢奸汪精衛(wèi)，繼續(xù)爭(zhēng)取同蔣介石集團(tuán)合作，鞏固并擴(kuò)大抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線，駕馭了整個(gè)局勢(shì)的發(fā)展。

在日軍將敵后抗日根據(jù)地作為軍事進(jìn)攻主要對(duì)象的情況下，黨領(lǐng)導(dǎo)人民抗日力量肩負(fù)起抗擊日軍的主要責(zé)任。根據(jù)黨中央的戰(zhàn)略決策，八路軍于1938年冬開(kāi)始由山區(qū)向平原地區(qū)挺進(jìn)，放手發(fā)動(dòng)群眾，廣泛深入地發(fā)展群眾性游擊戰(zhàn)爭(zhēng)，不斷消滅敵人的有生力量，鞏固和擴(kuò)大了晉察冀、晉冀豫、冀魯豫、晉西北、山東等抗日根據(jù)地。在晉察冀軍民反“掃蕩”作戰(zhàn)中，1939年11月，偉大的共產(chǎn)主義戰(zhàn)士、加拿大共產(chǎn)黨員諾爾曼·白求恩大夫在搶救八路軍傷員時(shí)不幸感染中毒，為中國(guó)人民的解放事業(yè)獻(xiàn)出了生命。

1940年8月，為了粉碎敵人對(duì)華北抗日根據(jù)地的“掃蕩”和“囚籠”政策，八路軍總部對(duì)華北日軍發(fā)動(dòng)了一次大規(guī)模的以破襲敵人交通線為重要目標(biāo)的進(jìn)攻戰(zhàn)役。參戰(zhàn)部隊(duì)有105個(gè)團(tuán)約20萬(wàn)人，故稱(chēng)百團(tuán)大戰(zhàn)。這次戰(zhàn)役共作戰(zhàn)1824次，斃傷日、偽軍2.5萬(wàn)余人，俘1.8萬(wàn)余人，破壞鐵路470余公里、公路1500余公里，摧毀大量敵碉堡和據(jù)點(diǎn)，繳獲大批槍炮和軍用物資，因而沉重地打擊敵軍，激發(fā)了全國(guó)人民的抗戰(zhàn)熱情，進(jìn)一步提高了共產(chǎn)黨和八路軍的威望。

與此同時(shí)，新四軍各部貫徹黨中央“發(fā)展華中”的戰(zhàn)略方針，利用山地、平原和河湖港汊等復(fù)雜地形開(kāi)展游擊戰(zhàn)，建立了皖東、豫皖蘇、皖東北、豫鄂、蘇北等抗日根據(jù)地，堅(jiān)持和擴(kuò)大蘇南、皖中等根據(jù)地，溝通了華北與華中抗日根據(jù)地的聯(lián)系。在華南，黨領(lǐng)導(dǎo)的抗日武裝創(chuàng)建和發(fā)展東江、瓊崖等抗日游擊根據(jù)地，開(kāi)展廣泛的抗日游擊戰(zhàn)爭(zhēng)。日本侵略者陷入人民戰(zhàn)爭(zhēng)的汪洋大海之中。

到1940年底，黨領(lǐng)導(dǎo)的軍隊(duì)由抗戰(zhàn)開(kāi)始時(shí)的5萬(wàn)余人發(fā)展到50萬(wàn)人，還有大量地方武裝和民兵?？谷崭鶕?jù)地發(fā)展到跨華北、華中、華南的廣大地區(qū)，加上陜甘寧邊區(qū)共17塊近1億人口。黨領(lǐng)導(dǎo)的敵后抗戰(zhàn)，大量牽制、消滅日軍，在全民族抗戰(zhàn)中發(fā)揮著日益重要的作用，逐步成為中國(guó)抗戰(zhàn)的重心。

在淪陷區(qū)城市和交通要道，黨的地下組織實(shí)行隱蔽精干、長(zhǎng)期埋伏、積蓄力量、以待時(shí)機(jī)的方針，徹底轉(zhuǎn)變工作方式，深入群眾，以隱蔽的方式開(kāi)展抗日宣傳教育和統(tǒng)一戰(zhàn)線工作，領(lǐng)導(dǎo)人民進(jìn)行多種形式的抗日斗爭(zhēng)，牽制敵人的兵力，打擊日偽統(tǒng)治，支持和配合了敵后游擊戰(zhàn)爭(zhēng)和抗日根據(jù)地的建立與鞏固。

黨在國(guó)民黨統(tǒng)治區(qū)的工作也取得新的進(jìn)展。1939年1月，中共中央南方局在重慶成立。在周恩來(lái)、董必武等人領(lǐng)導(dǎo)下，南方局在統(tǒng)一戰(zhàn)線、黨的建設(shè)、宣傳文化、群眾工作等方面進(jìn)行了艱苦而卓有成效的工作。南方局特別重視爭(zhēng)取和團(tuán)結(jié)中間勢(shì)力，同民主黨派、無(wú)黨派人士、國(guó)民黨民主派、地方實(shí)力派、著名知識(shí)分子等廣泛接觸，共商國(guó)是，使他們了解共產(chǎn)黨的主張，并逐步取得他們的信任，鞏固擴(kuò)大了抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線，推動(dòng)了國(guó)民黨統(tǒng)治區(qū)抗日民主運(yùn)動(dòng)的發(fā)展。在周恩來(lái)和南方局的支持下，1941年3月，中國(guó)民主政團(tuán)同盟(1944年9月改組為中國(guó)民主同盟，簡(jiǎn)稱(chēng)民盟)在重慶成立，成為中國(guó)民主運(yùn)動(dòng)的一支生力軍。南方局在開(kāi)展國(guó)際統(tǒng)一戰(zhàn)線工作方面同樣取得很大成績(jī)，爭(zhēng)取了國(guó)際社會(huì)對(duì)中國(guó)團(tuán)結(jié)抗戰(zhàn)的同情和支持，擴(kuò)大了黨的影響。

黨在西北國(guó)民黨統(tǒng)治區(qū)的地方組織，領(lǐng)導(dǎo)和推動(dòng)抗日救亡的群眾運(yùn)動(dòng)，開(kāi)展廣泛的統(tǒng)一戰(zhàn)線工作，利用西北特殊的地理?xiàng)l件溝通黨和國(guó)際友人、海外僑胞的關(guān)系及與共產(chǎn)國(guó)際的聯(lián)系，支持和配合了陜甘寧邊區(qū)建設(shè)和全國(guó)抗戰(zhàn)。

黨堅(jiān)持團(tuán)結(jié)反對(duì)分裂、堅(jiān)持進(jìn)步反對(duì)倒退，同國(guó)民黨頑固派的反共活動(dòng)進(jìn)行了堅(jiān)決斗爭(zhēng)。1939年冬至1940年春，國(guó)民黨頑固派掀起第一次反共高潮，黨給予堅(jiān)決回?fù)簟?941年初，國(guó)民黨頑固派制造震驚中外的皖南事變。新四軍軍部及所屬部隊(duì)9000余人，在向北轉(zhuǎn)移途中遭到國(guó)民黨軍8萬(wàn)余人圍攻，除約2000余人突圍外，一部被打散，大部壯烈犧牲或被捕，軍長(zhǎng)葉挺在同國(guó)民黨軍進(jìn)行戰(zhàn)場(chǎng)談判時(shí)被扣押，副軍長(zhǎng)項(xiàng)英遇害。事變發(fā)生后，蔣介石竟誣稱(chēng)新四軍“叛變”，宣布取消其番號(hào)。

面對(duì)國(guó)民黨頑固派掀起的又一次反共高潮，共產(chǎn)黨采取軍事上嚴(yán)守自衛(wèi)、政治上堅(jiān)決反擊的方針。中共中央軍委宣布重建新四軍軍部，任命陳毅為代軍長(zhǎng)，劉少奇為政治委員。毛澤東揭露國(guó)民黨頑固派破壞抗戰(zhàn)的陰謀，提出懲辦禍?zhǔn)住⑨尫湃~挺、廢除國(guó)民黨一黨專(zhuān)政、實(shí)行民主政治等十二條解決辦法。周恩來(lái)在重慶向國(guó)民黨當(dāng)局提出嚴(yán)重抗議，并親筆題詞“為江南死國(guó)難者志哀”和“千古奇冤，江南一葉；同室操戈，相煎何急?!”這兩條充滿(mǎn)悲憤的題詞在《新華日?qǐng)?bào)》登出，有力地揭露和聲討了國(guó)民黨頑固派的反動(dòng)行徑。

全國(guó)人民及國(guó)際輿論普遍同情共產(chǎn)黨，譴責(zé)國(guó)民黨當(dāng)局消滅異己、破壞抗戰(zhàn)。國(guó)民黨頑固派陷于極端孤立的境地，其反共活動(dòng)不得不有所收斂。黨以大局為重的正確措置，使極度危急的國(guó)內(nèi)時(shí)局得以扭轉(zhuǎn)，黨在全國(guó)的政治地位空前提高。

黨深刻地總結(jié)同國(guó)民黨頑固派斗爭(zhēng)的經(jīng)驗(yàn)，豐富和發(fā)展了統(tǒng)一戰(zhàn)線的策略。這主要是:在抗日民族統(tǒng)一戰(zhàn)線中要采取“發(fā)展進(jìn)步勢(shì)力，爭(zhēng)取中間勢(shì)力，孤立頑固勢(shì)力”的總方針，在反對(duì)國(guó)民黨頑固派的斗爭(zhēng)中要堅(jiān)持“人不犯我，我不犯人，人若犯我，我必犯人”的自衛(wèi)立場(chǎng)和“有理、有利、有節(jié)”的原則。這些策略原則使黨得以在復(fù)雜多變的環(huán)境里更加熟練而恰當(dāng)?shù)靥幚斫y(tǒng)一戰(zhàn)線中的各種棘手問(wèn)題，避免犯“左”、右傾錯(cuò)誤。

在此期間，針對(duì)國(guó)民黨大肆鼓吹“共產(chǎn)主義不適合中國(guó)國(guó)情”等反共謬論，黨在政治思想戰(zhàn)線上同國(guó)民黨展開(kāi)論戰(zhàn)，批判和揭露各種假三民主義，著重闡述三民主義與共產(chǎn)主義的關(guān)系，說(shuō)明共產(chǎn)主義的最低綱領(lǐng)和新三民主義基本相同，但兩者又有區(qū)別，共產(chǎn)黨將同一切真誠(chéng)的三民主義者長(zhǎng)期合作。這場(chǎng)論戰(zhàn)對(duì)新民主主義理論體系的形成起了推動(dòng)作用。

為了駁斥國(guó)民黨頑固派的反共宣傳，向全黨和全國(guó)人民闡明共產(chǎn)黨對(duì)于中國(guó)革命及其前途的全部見(jiàn)解，回答中國(guó)向何處去這個(gè)關(guān)系重大的問(wèn)題，更好地指導(dǎo)抗戰(zhàn)和中國(guó)革命，毛澤東進(jìn)行了大量的理論研究工作。他系統(tǒng)總結(jié)中國(guó)革命的獨(dú)創(chuàng)性經(jīng)驗(yàn)，于1939年底1940年初先后發(fā)表《<共產(chǎn)黨人>發(fā)刊詞》、《中國(guó)革命和中國(guó)共產(chǎn)黨》、《新民主主義論》等著作，完整地闡述了新民主主義理論。